Ende des 19. Jahrhunderts wirkte Dr. Mikao Usui, ein christlicher Priester, an einer kleinen Universität in Kyoto (Japan). An einem sonntäglichen Gottesdienst wurde Usui von einem Student gefragt ob er den Inhalt der Bibel wörtlich nehmen würde und an den Inhalt glaube. Usui bejahte dies. Der Student aber sagte: " Dieser blinde Glaube genügt mir aber nicht. Ich möchte diese Dinge mit eigenen Augen sehen." Dies veranlasste Usui in die USA nach Chicago zu reisen und dort an der Universität die christlichen Schriften zu studieren. Da hoffte er auf nähere Informationen. Da er aber nicht fündig wurde reiste er zurück nach Japan um in den buddhistischen Lehren weiter zu suchen.
Schliesslich fand er in einer alten Sanskrit Schrift wonach er gesucht hatte. Nachdem Usui einige Zeit im Kloster verbracht hatte, entschied er sich in die Bettlerviertel von Kyoto zu gehen um den Leuten zu helfen. Da machte er die Erfahrung, dass es nicht reicht den physischen Körper zu heilen, sondern auch die Lebenseinstellung angepasst werden muss. Darauf begann Usui zu unterrichten und gab auch die entsprechenden Lebensregeln dazu weiter. Einer seiner prominentesten Schüler war Dr. Chujiro Hayaschi, welcher schliesslich in Tokyo eine Reiki Klinik gründete.
In den 30er Jahren reiste Frau Hawayo Takata (Hawaii) nach Japan um sich einer ärztlichen Behandlung zu unterziehen. Schliesslich hörte sie von der Reiki Klinik und liess sich von Dr. Chujiro Hayaschi behandeln. Hawayo Takata war so beeindruckt, dass sie sich entschloss selber Reiki zu lernen. Nach den Abschluss der Ausbildung kehrte sie wieder nach Hawaii zurück, wo sie begann die Reiki Lehre weiter zu verbreiten. Damit begann die Verbreitung von Reiki auch in der westlichen Welt. Bald wurde auch Europa erreicht.
Seither wird Reiki überall auf dieser Welt gelehrt und angewendet.